- Il plasmide di espressione del lentivirus viene prima progettato per contenere il gene di interesse guidato dal promotore TRE (elemento di risposta alla tetraciclina) in una semplice fase di clonazione del gate, e quindi co-trasfettato nelle cellule HEK293T insieme ai plasmidi di confezionamento e involucro per produrre il virus.
- Il virus viene utilizzato per infettare il tipo cellulare di interesse a un MOI basso tale che la maggior parte delle cellule trasdotte contenga una singola integrazione virale. Le cellule infette vengono coltivate con la selezione e l’integrazione del virus viene verificata mediante qPCR.
- L’espressione genica nelle cellule trasdotte stabilmente è indotta dalla doxiciclina e convalidata da qPCR, immunoblotting e citometria a flusso.
- Questa piattaforma di espressione lentivirale flessibile può essere utilizzata per indurre in modo stabile e forte un gene di interesse in una varietà di cellule per una varietà di applicazioni. Riepilogo grafico: una panoramica schematica della trasduzione lentivirale nelle cellule THP-1.
Impatto minimo di ZAP sulla produzione di vettori lentivirali e sull’efficienza di trasduzione
- La proteina ZAP antivirale lega i dinucleotidi CpG sull’RNA virale, inibendo la replicazione. Ciò probabilmente ha portato alla soppressione di CpG osservata in molti virus a RNA, inclusi i retrovirus. Le sequenze aggiunte ai genomi dei vettori retrovirali, come promotori interni, transgeni o elementi regolatori, aumentano notevolmente l’abbondanza di CpG. Poiché questi CpG possono consentire a ZAP di indirizzare il vettore RNA retrovirale, abbiamo analizzato se questa riduzione della produzione del vettore, dell’efficienza di trasduzione e dell’espressione del transgene.
- Sorprendentemente, sebbene l’HIV-1 ad alto contenuto di CpG sia stato effettivamente inibito da ZAP nelle cellule HEK293T, l’esaurimento di ZAP non ha aumentato significativamente il titolo del vettore lentivirale utilizzando diversi plasmidi genomici e di confezionamento . Anche la sovraespressione di ZAP non ha inibito il titolo del vettore lentivirale. Inoltre, una riduzione dell’abbondanza di CpG nel genoma del vettore lentivirale non ha aumentato il suo titolo e il vettore gammaretrovirale derivato dal virus della leucemia murina non è stato significativamente limitato da ZAP.
- Nel complesso, dimostriamo che la maggiore quantità di CpG nei vettori retrovirali rispetto ai retrovirus di tipo selvaggio da cui derivano non li rende intrinsecamente sensibili allo ZAP. Un’ulteriore comprensione del modo in cui ZAP mira specificamente alle trascrizioni per inibire la loro espressione può consentire lo sviluppo di contesti di sequenza CpG che reclutano o aggirano con successo questo sistema antivirale .
Guida alla produzione di vettori lentivirali per cellule difficili da trasfettare utilizzando cellule che esprimono c-kit derivate dal cuore come sistema modello
- La terapia genica è la modifica del corredo genetico mediante l’introduzione di acidi nucleici estranei nelle cellule bersaglio attraverso metodi di rilascio genico per il trattamento di una specifica malattia.
- Sebbene i geni bersaglio svolgano un ruolo chiave nella terapia genica, anche il sistema di rilascio del gene utilizzato è di grande importanza nel determinare il successo della terapia genica. Poiché le cellule primarie e le cellule staminali sono spesso bersagli della terapia genica negli studi clinici, il sistema di somministrazione dovrebbe essere robusto e le voci basate su virus come i vettori lentivirali funzionano meglio per trasportare il transgene nelle cellule. Tuttavia, anche all’interno dei vettori lentivirali , diversi parametri possono influenzare la funzionalità del sistema di rilascio .
- Utilizzando cellule che esprimono c-kit (CC) derivate dal cuore come sistema modello , il presente studio mira a ottimizzare la produzione lentivirale studiando vari fattori sperimentali come la produzione del sistema lentivirale , il metodo di concentrazione e il tipo di marcatore selezionabile. I nostri risultati hanno mostrato che il sistema di seconda generazione con pCMV-dR8.2 dvpr come plasmide di confezionamento ha comportato un’efficienza di produzione di lentivirus 7,3 volte superiore rispetto a psPAX2.
- La concentrazione del virus dell’ultracentrifuga ha determinato un titolo del virus più elevato a oltre 5×105 unità infettive /ml (IFU/ml). Infine, la concentrazione inibitoria minima (MIC) del marcatore di selezione della puromicina era di 10 µg/ml e 7 µg/ml per HEK293T e CC, indicando l’utilità della selezione di antibiotici per tutti i tipi cellulari. Questi dati incoraggianti possono essere estrapolati e applicati ad altre cellule difficili da trasfettare, come diversi tipi di cellule staminali o cellule primarie.
Sistema cellulare di confezionamento inducibile per la produzione sicura ed efficiente di vettori lentivirali in assenza di proteine helper dell’HIV-1.
- I vettori lentivirali basati sul virus dell’immunodeficienza umana di tipo 1 (HIV-1) hanno la capacità di fornire geni esogeni a cellule in divisione e non e quindi stabilire un provirus stabile in queste cellule bersaglio, che può consentire l’espressione a lungo termine del trasferimento gene. Qui descriviamo una linea cellulare di confezionamento stabile che è priva di HIV-1 tat, vif, vpr, vpu e nef. Al fine di evitare qualsiasi rischio di citotossicità associato all’espressione costitutiva della proteasi HIV-1 o della proteina dell’involucro VSV-G, la trascrizione del pacchetto e dei costrutti dell’involucro è stata strettamente controllata mediante l’uso di un sistema indotto da ecdisone .
- Usando questa linea cellulare, siamo stati in grado di generare costantemente stock concentrati di vettori virali pseudotipizzati con titoli nell’intervallo di 10 (8) UI / ml, che possono trasdurre in modo efficiente cellule in vitro che si dividono attivamente e inibiscono la crescita. Questa nuova linea cellulare di confezionamento di vettori lentivirali facilita la produzione di stock di virus ad alto titolo in assenza di virus competenti per la replicazione e ci fornisce uno strumento importante per la futura ricerca sul trasferimento genico.
Generazione, confezionamento e trasduzione di virus su piattaforma microfluidica digitale
- I sistemi virali sono un metodo di consegna popolare per l’introduzione di materiale genetico esogeno nelle cellule dei mammiferi. Sfortunatamente, la preparazione dei lentivirus contenenti il macchinario per l’editing cellulare è laboriosa e le fasi richiedono ottimizzazione e manipolazione delicata. Per mitigare queste sfide, stiamo introducendo il primo metodo microfluidico che combina produzione, confezionamento e trasduzione di lentivirus . Il nuovo metodo consente la produzione di titoli virali compresi tra 106 e 107 (simile alla produzione su macroscala) e un’elevata efficienza di trasduzione per linee cellulari difficili da trasfettare.
ViraSafe Lentiviral Expression System (Neo) Ecotropic |
|||
VPK-213-ECO | Cell Biolabs | 1 kit | 1163 EUR |
ViraSafe Lentiviral Expression System (Neo), Pantropic |
|||
VPK-213-PAN | Cell Biolabs | 1 kit | 1163 EUR |
ViraSafe Lentiviral Expression System (Hygro), Ecotropic |
|||
VPK-214-ECO | Cell Biolabs | 1 kit | 1163 EUR |
ViraSafe Lentiviral Expression System (Hygro), Pantropic |
|||
VPK-214-PAN | Cell Biolabs | 1 kit | 1163 EUR |
ViraSafe Lentiviral Bicistronic Expression System (Puro), Ecotropic |
|||
VPK-215-ECO | Cell Biolabs | 1 kit | 1163 EUR |
ViraSafe Lentiviral Bicistronic Expression System (Puro), Pantropic |
|||
VPK-215-PAN | Cell Biolabs | 1 kit | 1163 EUR |
ViraSafe Lentiviral Bicistronic Expression System (Neo), Ecotropic |
|||
VPK-216-ECO | Cell Biolabs | 1 kit | 1163 EUR |
ViraSafe Lentiviral Bicistronic Expression System (Neo), Pantropic |
|||
VPK-216-PAN | Cell Biolabs | 1 kit | 1163 EUR |
ViraSafe Lentiviral Bicistronic Expression System (Hygro), Ecotropic |
|||
VPK-217-ECO | Cell Biolabs | 1 kit | 1163 EUR |
ViraSafe Lentiviral Bicistronic Expression System (Hygro), Pantropic |
|||
VPK-217-PAN | Cell Biolabs | 1 kit | 1163 EUR |
ViraSafe Lentiviral Bicistronic Expression System (Blasticidin), Ecotropic |
|||
VPK-219-ECO | Cell Biolabs | 1 kit | 1163 EUR |
ViraSafe Lentiviral Bicistronic Expression System (Blasticidin), Pantropic |
|||
VPK-219-PAN | Cell Biolabs | 1 kit | 1163 EUR |
AAV-DJ Helper Free Packaging System |
|||
VPK-400-DJ | Cell Biolabs | 1 kit | 972 EUR |
AAV-1 Helper Free Packaging System |
|||
VPK-401 | Cell Biolabs | 1 kit | 972 EUR |
AAV-2 Helper Free Packaging System |
|||
VPK-402 | Cell Biolabs | 1 kit | 972 EUR |
AAV-3 Helper Free Packaging System |
|||
VPK-403 | Cell Biolabs | 1 kit | 972 EUR |
AAV-4 Helper Free Packaging System |
|||
VPK-404 | Cell Biolabs | 1 kit | 972 EUR |
AAV-5 Helper Free Packaging System |
|||
VPK-405 | Cell Biolabs | 1 kit | 972 EUR |
AAV-6 Helper Free Packaging System |
|||
VPK-406 | Cell Biolabs | 1 kit | 972 EUR |
AAV-DJ/8 Helper Free Packaging System |
|||
VPK-400-DJ-8 | Cell Biolabs | 1 kit | 972 EUR |
Lentivirus Packaging Kit |
|||
P904 | 101Bio | - | Ask for price |
Retrovirus Packaging Kit |
|||
P905 | 101Bio | - | Ask for price |
SynaptoGreenâ„¢ C3 (special packaging): (5x1mg) |
|||
70026 | Biotium | 5ST | 320 EUR |
SynaptoGreen C5 (special packaging): (5x1mg) |
|||
70047 | Biotium | 5ST | 320 EUR |
Gryphon Packaging Cell Selection Medium |
|||
ABP-TC-PHSM050 | Allele Biotech | 50 ml | Ask for price |
pPACKF1 FIV Lentivector Packaging Kit |
|||
LV100A-1 | SBI | 10 transfections | 616 EUR |
pPACKH1 HIV Lentivector Packaging Kit |
|||
LV500A-1 | SBI | 10 transfections | 591 EUR |
pPACK-ID: Integrase-defective lentiviral packaging mix (15 reactions) |
|||
LV520A-ID | SBI | 15 reactions | 697 EUR |
pPACK-ID: Integrase-defective lentiviral packaging mix (30 reactions) |
|||
LV525A-ID | SBI | 30 reactions | 1132 EUR |
pPACKH1-XL HIV Lentivector Packaging Kit |
|||
LV510A-1 | SBI | 25 transfections | 1242 EUR |
Platinum-E Retroviral Packaging Cell Line, Ecotropic |
|||
RV-101 | Cell Biolabs | 1 vial | 920 EUR |
Platinum-A Retroviral Packaging Cell Line, Amphotropic |
|||
RV-102 | Cell Biolabs | 1 vial | 920 EUR |
Platinum-GP Retroviral Packaging Cell Line, Pantropic |
|||
RV-103 | Cell Biolabs | 1 vial | 920 EUR |
pPACKF1 FIV Lentivector Packaging Kit (50 reactions) |
|||
LV100A-5 | SBI | 50 transfections | 2341 EUR |
ProtoBlock System |
|||
NAT1004 | National Diagnostics | 1KIT | 102 EUR |
data acquisition system |
|||
D230 | Consort | ea | 1704 EUR |
CCD cooling system |
|||
3600100 | Atto | 1unit | 4914 EUR |
Fast Mutagenesis System |
|||
20-abx098073 | Abbexa |
|
|
CometAssay Electrophoresis System |
|||
4250-050-ES | Biotechne | 1 Kit | 2950.8 EUR |
Cometslides Rack System |
|||
4252-040-02 | Biotechne | 1 Each | 213.8 EUR |
photo documentation system |
|||
VLBPCX4-20M | Consort | ea | 6352 EUR |
photo documentation system |
|||
VLBPCX4-20MX | Consort | ea | 6774 EUR |
photo documentation system |
|||
VLDP-HOOD | Consort | ea | 5084 EUR |
photo documentation system |
|||
VLDP17-26M | Consort | ea | 8126 EUR |
photo documentation system |
|||
VLDP17-26MX | Consort | ea | 8464 EUR |
AEC coloring system |
|||
CT356 | U-CyTech | 10-plate | 141 EUR |
SynaptoRed C2M, special packaging (also known as FM5-95): (5x1mg) |
|||
70019 | Biotium | 5ST | 401 EUR |
CMV-hspCas9-T2A-Puro SmartNuclease Lentivector Plasmid + LentiStarter Packaging Kit |
|||
CASLV100PA-KIT | SBI | 1 Kit | 1132 EUR |
CMV-hspCas9-EF1-GFP SmartNuclease Lentivector Plasmid + LentiStarter Packaging Kit |
|||
CASLV105PA-KIT | SBI | 1 Kit | 1132 EUR |
MSCV-hspCas9-T2A-Puro SmartNuclease Lentivector Plasmid + LentiStarter Packaging Kit |
|||
CASLV120PA-KIT | SBI | 1 Kit | 1132 EUR |
MSCV-hspCas9-EF1-GFP SmartNuclease Lentivector Plasmid + LentiStarter Packaging Kit |
|||
CASLV125PA-KIT | SBI | 1 Kit | 1132 EUR |
sequencing system 20x50 cm |
|||
ESEQ1200-SYS | Consort | ea | 1535 EUR |
modular system 10x10 cm |
|||
EVS1100-MULTI | Consort | ea | 1197 EUR |
modular system 20x10 cm |
|||
EVS1200-MULTI | Consort | ea | 1451 EUR |
modular system 20x20 cm |
|||
EVS1300-MULTI | Consort | ea | 1958 EUR |
vertical system 10x10 cm |
|||
EVS3100-SYS | Consort | ea | 775 EUR |
vertical system 20x10 cm |
|||
EVS3200-SYS | Consort | ea | 1451 EUR |
vertical system 20x20 cm |
|||
EVS3300-SYS | Consort | ea | 1704 EUR |
mini system 7x8 cm |
|||
EHS3100-SYS | Consort | ea | 437 EUR |
mini system 8x10 cm |
|||
EHS1050-SYS | Consort | ea | 352 EUR |
Fast MultiSite Mutagenesis System |
|||
abx098861-10rxns | Abbexa | 10 rxns | 690 EUR |
myGel Mini Electrophoresis System |
|||
BM0286 | GenDepot | System | 618 EUR |
96-Well Vacuum System |
|||
SD5011 | Bio Basic | 1 UNIT | 324.05 EUR |
amfiRivert Reverse Transcription System |
|||
R5200-050 | GenDepot | 50 rxns | 388 EUR |
EasyDip Slide Staining System |
|||
M900-12AS-ASSORTED | ScyTek Laboratories | 1 Case(s) | 176 EUR |
cfMAX cfDNA Isolation System |
|||
CFMAX100A-1 | SBI | 1 Kit | 479 EUR |
Episomal iPSC Reprogramming System |
|||
SC900A-1 | SBI | 5 reactions | 968 EUR |
FractionPREP Cell Fractionation system |
|||
55R-1359 | Fitzgerald | 50 assays | 758 EUR |
mini vertical system 10x10 cm |
|||
EVS1100-SYS | Consort | ea | 606 EUR |
mini vertical system 20x10 cm |
|||
EVS1200-SYS | Consort | ea | 859 EUR |
maxi vertical system 20x20 cm |
|||
EVS1300-SYS | Consort | ea | 1138 EUR |
data acquisition system 120 vac |
|||
D230-US | Consort | ea | 1704 EUR |
AXYGEN® GEL DOCUMENTATION SYSTEM |
|||
GD-1000 | CORNING | 1/pk | 4670 EUR |
EpiNext DNA Purification HT System |
|||
P-1063 | EpiGentek | 480 ml | 6022.55 EUR |
Platinum Retroviral Expression System, Ecotropic |
|||
VPK-300 | Cell Biolabs | 1 kit | 1169 EUR |
Platinum Retroviral Expression System, Amphotropic |
|||
VPK-301 | Cell Biolabs | 1 kit | 1169 EUR |
Platinum Retroviral Expression System, Pantropic |
|||
VPK-302 | Cell Biolabs | 1 kit | 1169 EUR |
Rabbit Reticulocyte Lysate System (untreated) |
|||
20-abx800016 | Abbexa |
|
|
SequaGel Sequencing System 1L Kit |
|||
NAT1136 | National Diagnostics | 1KIT | 143 EUR |
SequaGel Sequencing System 2.2L Kit |
|||
NAT1138 | National Diagnostics | EACH | 211 EUR |
HISTAR DETECTION SYSTEM Kits (OKSA11259) |
|||
OKSA11259 | Aviva Systems Biology | 50 Tests | 565 EUR |
HISTAR DETECTION SYSTEM Kits (OKSA11260) |
|||
OKSA11260 | Aviva Systems Biology | 150 Tests | 1335 EUR |
HISTAR DETECTION SYSTEM Kits (OKSA11261) |
|||
OKSA11261 | Aviva Systems Biology | 500 Tests | 2019 EUR |
Manual Staining System (12 Wells) |
|||
IMS001 | ScyTek Laboratories | 1 ea. | 356 EUR |
Slidefile Storage System 100 Positions |
|||
M700-100W-WHITE | ScyTek Laboratories | 1 Case(s) | 192 EUR |
Stain Tray Slide Staining System |
|||
M920-1 | ScyTek Laboratories | 1 Clear | 428 EUR |
Stain Tray Slide Staining System |
|||
M920-2 | ScyTek Laboratories | 1 Black | 445 EUR |
Gryphon Retroviral Expression System I |
|||
ABP-RVK-10001 | Allele Biotech | 1 set | Ask for price |
Gryphon Retroviral Expression System II |
|||
ABP-RVK-10002 | Allele Biotech | 1 set | Ask for price |
Gryphon Amphotropic Packaging Cell Line for Retrovirus (1 x 106 cells, Frozen) |
|||
ABP-RVC-10001 | Allele Biotech | 1 vial | Ask for price |
Gryphon Amphotropic Packaging Cell Line for Retrovirus (1 x 106 cells, Culture) |
|||
ABP-RVC-10001C | Allele Biotech | 1 flask | Ask for price |
Gryphon Ecotropic Packaging Cell Line for Retrovirus (1 x 106 cells, Frozen) |
|||
ABP-RVC-10002 | Allele Biotech | 1 vial | Ask for price |
Gryphon Ecotropic Packaging Cell Line for Retrovirus (1 x 106 cells, Culture) |
|||
ABP-RVC-10002C | Allele Biotech | 1 flask | Ask for price |
AXYGEN® GEL DOCUMENTATION SYSTEM BL |
|||
GDBL-1000 | CORNING | 1/pk | 7632 EUR |
Estendiamo questa tecnica alle applicazioni di editing genetico e mostriamo come può essere utilizzata per disattivare e disattivare il gene del recettore degli estrogeni, il gene responsabile del 70% dei casi di cancro al seno. Questa nuova tecnica è automatizzata con capacità di multiplexing che hanno il potenziale per standardizzare l’ingegneria del genoma basata su virus.